Sjoerd Slagter studeerde af in Biologie en Filosofie aan de Universiteit van Utrecht. Hij startte zijn carrière op het Corderiuscollege in Amersfoort, waar hij 18 jaar werkzaam was, eerst als docent en later als conrector onderbouw. In 1997 werd hij directeur van ROC ASA te Amersfoort. Vanaf 2001 was Slagter voorzitter van de centrale directie

van het Agnieten College en bestuurslid van de Besturenraad.
Sinds de start in 2006 is Sjoerd Slagter voorzitter van de VO-Raad, de sectororganisatie voor het voortgezet onderwijs. Daarnaast is hij lid van de Raad van Toezicht van Humanitas, betrokken bij diverse internationale organisaties voor schoolleiders en auteur van het boek ‘Leren Filosoferen’.